動物科學技術系現有動物醫學、寵物養護與馴導和水產養殖3個專業。我院是上海市職業院校中唯一一個開設動物醫學專業的院校。動醫專業是上海085工程重點專業、上海市特色院校建設重點專業和上海市高職院校一流專業，也是我校首先實行中高貫通的專業。
校內擁有10個實驗實訓室、1個動物實訓醫院，初步形成了集教學、生產、培訓、技能鑒定、技術推廣等功能于一體的校內實訓基地。開發的動物診療模型和動物虛擬數字化教學資源庫，在全國同類院校中處于領先地位。
現有教職工21名，研究生以上學歷占76%以上。其中教授1名，副教授4名，中級職稱6名。另外聘請企業專家兼職教師20多名。市級精品課程2門；擁有1個“動物醫學”市級教學團隊和1名市級教學名師。本系教師發表了60多篇教學和科研論文；主編高職教材10本、副主編15本、參編20本；多名教師被聘為企業技術顧問或技術指導，參與企業生產管理，為企業提供技術服務。
積極開展人才培養模式的改革創新工作，踐行“雙主體”試點班和“現代學徒制”等人才培養新模式。招生生源穩定，學生在全國農業技能大賽中屢獲大獎，如：第二屆全國高等職業院校農業職業技能大賽動物外科手術項目比賽中獲得一等獎、2011年全國職業院校技能大賽農業技能大賽獲得團體項目《動物外科手術》二等獎等。歷屆畢業生在上海市農業系統發揮著積極作用。
本系注重學生的綜合素質培養，充分發揮學生社團和志愿者服務團隊等第二課堂育人作用。寵物之家社團獲得“上海市高校優秀社團”、陽光之家志愿者服務隊被評為“上海市扶殘助殘先進集體”、軌道交通志愿者服務隊多次獲得市級表彰等，多名學生獲得國家獎學金、上海市獎學金、上海市寶鋼獎學金、上海市優秀志愿者等榮譽表彰。本系承辦的“寵物嘉年華”系列活動，已經成為學院上農之春文化節上一道“大餐”，深受師生喜愛。動科系團總支獲得2015年度“上海市五四紅旗團支部”榮譽稱號。
